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6月10日16時16分，南京市氣象臺發布雷暴大風黃色預警信號：預計當天傍晚到上半夜，六合、浦口、江北新區、主城六區等的部分街道將出現8級以上雷暴大風，并可能伴有短時強降水、強雷電及冰雹等強對流天氣。為此，市防汛抗旱指揮部第一時間發布通知，要求做好相關防御應對。
南京市防汛抗旱指揮部辦公室要求，加強水務工程調度。密切關注天氣變化，科學精準調度水務工程，由市水務設施管理中心負責主城區水務設施具體排澇調度，做好玄武湖、內金川河等內河水位控制，及時啟動水務設施調度指令。各區負責的入河排口、堰閘、攔河截污壩等要及時打開，改善排澇條件；突出重點部位防御。城市地下空間（隧道、地鐵、地下車庫、下凹式立交等）、在建工地周邊道路、居民小區、低洼片區等可能積水受淹地段要重點防范。要加強高空構筑物、玻璃幕墻、廣告牌、行道樹、腳手架、塔吊等設施巡查檢查，發現問題及時處置。加強涉水建設工程、危房險房、地質災害點等安全檢查，提前做好船只回港避風和人員上岸避險，防止次生災害發生。
對于汛前確定的城市重點易積淹水點以及今年汛期出現的易積淹水點，特別是22處城市在建工地及周邊，須按照“一點一案”原則，設備人員提前就位。各區各單位要加強排澇設施巡查，防止雨水篦子、邊溝等遇雜物堵塞影響正常排水，發現情況及時處置。市、區防汛排澇搶險隊伍做好搶排積水準備。
另外，各區各部門要嚴格執行24小時值班制度，做到人員在崗在位，確保各項調度指令及時上傳下達。加強與氣象部門聯系對接，加強分析研判，做好監測預報預警，及時發布預警信息，針對性落實防御應對措施。市防指成員單位按照防汛職責分工，落實防御應對工作，加強信息收集，遇重要汛情、災情等第一時間報告。
